Jego prawdziwe imię to Tenzou (jap. テンゾウ, Tenzō?). Należy do ANBU. Okresowo jest kapitanem drużyny Kakashiego (Sai, Naruto Uzumaki, Sakura Haruno) i wyrusza z nią na misję sprowadzenia Sasuke do Konohy, która kończy się niepowodzeniem.

Zaraz po urodzeniu Yamato został porwany wraz z sześćdziesięcioma innymi ninja przez Orochimaru w celu przeprowadzenia eksperymentów z zaawansowaną linią krwi. W jego przypadku wstrzyknięto mu DNA Pierwszego Hokage w nadziei uzyskania jego unikatowych zdolności. Potrafi też kontrolować moc Kyuubi'ego za pomocą naszyjnika Pierwszego.

Orochimaru został zmuszony opuścić Konohę nie skończywszy swoich eksperymentów i jedyną osobą, która przeżyła okazał się Yamato. Okazało się przy tym, że badania Orochimaru zakończyły się sukcesem – Yamato posiadł możliwość operowania technikami elementu drewna, Mokuton.